太宰武陵王司马晞，自小喜欢练习武事，与袁真交情深厚，因而被桓温忌惮，想把他废了。当桓温把这想法告诉王彪之后，王彪之却说：“武陵王是皇亲至尊，没有什么明显的罪过，不能因为猜疑便将他废黜或贬徙。明公建立圣明，应当崇奖王室，与伊尹周公媲美。这是件大事，明公应当更加深思熟虑。”桓温说：“我已经决定了，这你不必再说了！”

由于王彪之不太配合，桓温只好动用了他一直不愿意动用的一步棋子——他的四弟桓秘。桓温知道，一旦动用桓秘，就没有解决不了的问题，但是，一旦动用桓秘，也许就会产生出不可预料的新问题，所以他过去一直不怎么重用他的这位聪明绝顶的四弟。

桓秘，字穆子，少有才气，不伦于俗。以秘书郎起家，后来逐步晋升为辅国将军、宣城内史。梁州刺史司马勋叛变入蜀的时候，桓秘以本官监梁益二州征讨军事、假节，将司马勋一举平定，他现职为散骑常侍，中领军。虽然跟普通士族相比，桓秘混得还算可以，但是如果要与其几个兄弟相比，那就相差得还是有点远：气焰熏天的桓温和已死二哥桓云就不提了；三哥桓豁时为监荆州、扬州、雍州军事，领南蛮校尉，荆州刺史，假节；五弟桓冲为监江州、荆州、豫州六郡诸军事，南中郎将，江州刺史，假节。这样的地位上的明显的区别，颇令心高气傲的桓秘所深深不忿，尤其是他最瞧不起的五弟桓冲居然在官职上压住他还不止一个头。当得知长兄的意思后，桓秘与郗超商议了半天，然后拿着一些郗超提供给他的密函就信心十足地走了。

晋简文帝咸安元年冬十一月十六日，朝廷尊奉褚太后为崇德太后，不再垂帘听政。

十一月十七日，手段高强的桓秘凭借手头上所掌握的证据，逼迫新蔡王司马晃到太极殿的西堂内自首，供称与司马晞及他的儿子司马综、著作郎殷涓、太宰长史庾倩、掾曹秀、舍人刘强、散骑常侍庾柔等阴谋作乱。在有关的人证、物证面前，简文帝司马昱对此只是流涕不已，一句话也说不出来。于是，桓温下令将上述被告全部收付廷尉审理。

十一月十九日，桓温下令将司马奕的田美人、孟美人以及两人所生的三位无辜的皇子，均用马缰绳残忍地勒死，以应儿歌上所预言的情形。

十一月二十日，御史中丞、谯王司马恬承桓温的旨意，请简文帝依律诛武陵王司马晞，简文帝司马昱下诏说：“悲伤惋惜，惶恐苦恼，不是朕忍心要听的，更何况说出来！请再详细商议吧！”这司马恬是司马承的孙子，司马无忌的儿子。想当初，司马恬的爷爷谯王司马承，以残破之长沙城誓死不与王敦妥协，始终维护着皇室的尊严，而此时的司马恬却心甘情愿地站在了桓温的一边，如果这时桓温手里没点硬货，这在情理上无论如何都难以说得通的。

十一月二十一日，桓温亲自出马，上表坚持诛杀司马晞，措辞表达得十分的严厉恳切。晋简文帝赐给桓温手诏说：“如果晋的国运神灵还长的话，明公便应当奉行前诏。如果晋的大运已去，朕请求自己退避让贤。”桓温看到简文帝的手诏写得这样的万念俱灰，感觉到自己已经把这个老实人逼到退无可退的地步了，一时间在心中涌出一股莫名的惊悸，平时很注重仪态的他脸上的神色也为之一变。一直以来，桓温都认为司马昱只不过是一个怂包而已，而此时，他才真正地感受到这一向软弱的清谈家也有做人的底线。

桓温觉得再这样坚持下去的话，恐怕就会激起不可预料的变化，只好再次上表：“晞体自皇极，故宠灵光世，不能率由王度，修己慎行，而聚纳轻剽，苞藏亡命。又息综矜忍，虐加于人。袁真叛逆，事相连染。顷自猜惧，将成乱阶。请免晞官，以王归藩。（司马晞出身于皇家，身份极其高贵，却不能遵守法度和修身慎行，而且聚纳钱财，巧取豪夺，包荫亡命之徒。又姑息儿子司马综的傲慢残忍，让他残酷地对待百姓。袁真叛逆之事，与他也有牵连。近日因为猜疑恐惧，几乎造成叛逆的局面。谨请免去司马晞的官职，以武陵王身份回归藩国。）”

桓温奏免武陵王晞，虽然是因为政治斗争使然，而其表奏中所列举的理由却实属当时宗室禁制。两晋时期的中央政府一直以来禁止宗室成员招徕轻侠、连接不逞，犯者严加惩处。这一做法沿袭汉制，主要是为了防止宗室成员藉此谋逆，因而危及皇权政治。据《晋书》卷37《宗室高阳王睦传》记载:“冀州刺史杜友奏睦招诱逋亡，不宜君国。”晋武帝对此严惩不贷，并因此削去了司马睦的王爵。

司马昱明白到司马晞确然有不法行为，而且其与袁真的关系也确实不同寻常，到了这个地步，如果拖着不处理司马晞的问题，恐怕也难遂桓温的心愿，最后也就只能同意按照桓温的意思免去了太宰、武陵王司马晞其世子司马综、梁王司马逢等官职，废司马晞及三子司马综、司马逢、司马遵为庶人，徙于新安郡。桓温派魏郡太守毛安之率领他所统领的部队宿卫殿中。毛安之是毛虎生（毛穆之）的弟弟。

桓温在将司马晞的问题解决后，就开始对庾冰的家族下手了，因为他们是司马奕的戚属，亦是司马奕试图抑制桓氏的重要依靠对象。庾冰共有七个儿子：庾希、庾袭、庾蕴、庾倩、庾邈、庾柔，同时，司马奕的妻子庾道怜也是庾冰的女儿，虽然庾道怜在司马奕继位后不久就去世了，但庾希兄弟毕竟是司马奕的内兄弟们，平时都好着呢。五年前，桓温已经因庾希丧师失地而罢免了庾希的徐兖二州的刺史职务，即使这样，现今庾氏家族的分量仍不可小觑：庾蕴为广州刺史；庾倩为太宰司马晞的长史；庾邈曾为司马昱的参军；庾柔是散骑常侍；尤其是最有才能和器局的庾倩，更是为桓温所忌惮。另外，桓温还想到了殷浩的儿子殷涓，殷涓也一直在社会上享有美名，他父亲殷浩去世后，桓温曾派人前去吊唁，殷涓既不答礼，事后也不去桓温那里拜谢，又一直与武陵王司马晞交往密切，似乎有所图谋。十一月二十二日，朝廷黜免新蔡王司马晃为庶人，将他迁徙到衡阳，殷涓、庾倩、曹秀、刘强、庾柔全都被判满门抄斩。广州刺史庾蕴在得知此消息后，知道自己必不能免，为了成全家人，就服毒而死。

本来庾蕴的哥哥、东阳太守庾友也不能免，碰巧庾友的妻子是桓温三弟桓豁的女儿桓女幼。桓女幼当时居住在建康，当她知道桓温要杀庾希等人的消息后，眼看庾友也难活命，情急之下就赤着脚跑去求见桓温，看门的人不肯让她进入，桓女幼就高声地骂道：“你这个狗奴才，竟敢不让我进我伯父的大门！”说着就强行闯入，见到桓温后她放声大哭说：“庾友是两腿相差三寸长的长短脚，连走路都经常靠别人搀扶，就他这副德性是作贼的料吗？”桓温见他的这个侄女简直遗传了他们桓家的全部的彪悍基因，就笑着说：“我根本无意杀他，只是他自己多心罢了。”于是就饶了庾友一门。毕竟，桓温与那些赶尽杀绝的jian雄相比，还是略有区别的。