二十年后，司马睿正式退隐永乐山庄，太子司马启继承皇位，开启天龙圣武皇朝，司马睿被尊为圣武祖皇帝，司马启是初代新皇。在此期间，大将军、卢太傅、太尉、任天豪等人相继去世，朝廷中魏希等人依然主持大局，而新的一代人才纷纷崛起。

随着天龙的复兴，司马一族的子嗣也兴盛了起来。司马睿继位四年，皇后逸馨生下太子司马启，启儿在逸馨和司徒玄的教导下，各方面能力非常优秀。十四年，司马启由朝臣选定为太子，二十四年，司马启二十岁，正式继位，开启天龙圣武皇朝时代。

宜妃程霜生长女司马薇，二十年嫁卢恒次子。丽妃任傲雪生长子司马原，次女司马宁，司马原接任北境军统领职位，司马宁嫁卢谦长子，和司马薇一起嫁入了卢家。淑妃南宫凌生一女，相随凌儿一生未嫁。

慧妃司徒静生一女，嫁一个普通游学者，游迹山林乡野间。黎妃殷黎生一女，继承殷黎的医学，创建黎轩阁，施救天下有病无法投医的困难者。柔妃皇甫柔生一女，嫁给魏希之子，吴希生一女，嫁给石田之子。

湘妃沐湘生一皇子，和谢俊女儿联姻。轩妃司马芊芊生一皇子，过继司马南，继任轩王。南蛮公主花阿蛮生一皇子，回去继承了夜叉之王。北雪公主纳兰飘雪生一皇子，回去继承了北原之王。西月公主乌扈弥月生一皇子，成为新的西域之王。

岚妃孟幽兰生一皇子，娶了章承幼女。香贵人香荷生女儿司马莲，嫁给了一个普通富户家庭。十二妃中，华妃华宸和明妃雪月都无出，其他贵人们都有一子或一女。三十六贵人后，司马睿再未选过秀女，然后民间传说，圣武皇帝司马睿在民间还有私生子女。

沐湘的女亲卫，叨叨和茆茆，一个生了皇子，一个生了公主，分别和吕原之女、高崇之子结合，暗中成立护龙山庄守卫组织，世代守护永乐山庄。乌扈弥月的侍女，艾娅、艾莎、艾妮、艾娜，纳兰飘雪的侍女，知书、知琴、知礼、知画，她们的子女全都回去成了贵族。

南蛮女王生下一对双胞胎修罗兄妹，在女王的熏陶下，兄妹非常相爱，但在司马睿的劝阻下，没有打破禁忌结合在一起，而是利用雪狐女和哥哥生下后代。花阿蛮的雪狐女，阿紫、阿红、阿青、阿蓝、阿绿各有子女，通过下一代的通婚，新的修罗一族开启了。

史载，天龙九九八年，司马睿继位，天龙一千年，宦官总管高靖谋逆被诛，司马睿开始亲政。不久，轩王司马南叛乱，司马睿被迫逃离中都，前往北都立足，和司马南相抗。

司马睿继位三年，率北军开始反攻，并且夺回天下大势，重回中都。不久，大军平定东都，轩王司马南俯首。此时，东岛沐家来犯，司马睿率军守御，成功击败沐家大军。接着，司马睿率军跨海出击，征服了沐家。

秋季，南蛮来犯，南境军统领楚浪遭到击败，军师司徒玄和龙耀将军先行前去抵挡。不久，司马睿亲征，突破叹息林，开始征服南蛮。大军连战连胜，南蛮夜叉之王高尔戈诚服，迎接司马睿前去见南蛮女王，并向天龙表示臣服。

南蛮归来，司马睿发出罪己诏，昭告天下，并守灵三日。接着，在三辅大臣的主持下，司马睿的册封大典在中都举行，董逸馨选为皇后，其他有十一妃，还有三十六贵人。