混沌初开，远古部落在三皇的带领下较为和平地生活了数万年。

直到有一天，化身炎帝的人皇神农氏在石牛峰炼制丹药之时，误食一株先天灵根孕育而出的毒草——断肠草，结果因为一时无法压制毒性，肚烂穿肠，毒发而亡。

神农氏死后，众圣又推选轩辕氏立为新人皇，又称之为黄帝。

但是原本在炎帝神农氏麾下的部落族长蚩尤氏不满轩辕氏为黄帝，取大量矿石以炎帝神农氏的炼器之法铸成枪、矛、戟、盾等兵器，联合星神夸父、风伯飞廉、雨师屏翳、灵神后羿、遁神银灵子、冥神神荼、郁垒的部落对黄帝轩辕氏的部落发动战争。

轩辕黄帝率领手下兵将联合远古的妖族大军在逐鹿之野与蚩尤交战，蚩尤引来混沌之气，化作迷雾重重，困住了黄帝的兵将，轩辕黄帝则在关键时刻参悟出万星之道，造出神器指南星车，顺利突破了蚩尤布下的迷障。

迷障困不住黄帝，蚩尤氏又派出飞廉屏翳施展洪荒之力，呼风唤雨而来，黄帝的军队无法抵挡，只好败退。

妖神二族领袖东皇太一见黄帝不敌蚩尤，便与女娲商议，最终女娲把上古卷轴龙甲神章交给轩辕黄帝，让其参悟其中奥义。东皇太一则派自己的十个儿子出马帮助黄帝，东皇十子化作本体，为十只三足金乌，是盘古之眼太阳的化身。十只三足金乌飞到空中，化作十个太阳，刹那间风停雨止，飞廉屏翳败退，后羿见三足金乌击败了飞廉屏翳，拿出自己的神弓，搭弓放箭，一连九箭击毙了九只三足金乌，在他欲杀第十子时，蚩尤欲留一子为人质，遂令后羿停止放箭，让夸父将其活捉。可是这第十子速度奇快，夸父追了它数十天依旧未能将其活捉，反倒是中途被黄帝麾下的神龙应龙截杀，那时夸父已然精疲力尽，无力抵抗，被应龙所杀。

而轩辕黄帝却因为九乌皆死，十子遁逃，无法抵抗飞廉屏翳的狂风暴雨，只好派出自己堕入魔道的女儿魔僵旱魁，旱魁现世，天地大旱，风雨即止，飞廉屏翳不敌旱魁之魔力，被其斩杀。